通過高通量的單細胞分析技術來解析組織中的細胞多樣性，這不僅開辟了新的研究途徑，還推動了新的研究發現。只有與組織、細胞空間位置信息相結合，這些單細胞研究的新發現才會變得更加豐富。對細胞空間模式的探索可以揭示正常和病變組織結構、免疫應答以及神經組織復雜分布的大量細節。

在真實組織環境中對細胞進行原位分析

原位分析

Xenium原位分析技術直接檢測并保留組織切片中數百個RNA靶點的細胞定位，無需常規測序技術輔助。這為研究人員提供了一張詳細的基因表達模式圖，且無需犧牲分辨率或靶點數量。

Xenium原位分析技術使用針對靶點基因特異性的可環化探針和目標RNA雜交，再通過環狀探針原位滾環擴增，擴增可供熒光標記探針雜交的基因特異性空間標簽序列。在Xenium分析儀上進行多輪熒光標記探針的雜交，每一輪雜交反應中，熒光標記探針和基因特異性空間標簽序列雜交，通過高分辨率顯微鏡掃描圖像，檢測每個熒光探針的位置，然后將熒光探針移除。連續幾輪的熒光探針雜交、成像和移除會在每一個特定探針雜交的位置產生熒光顏色“開"關模式，并而形成熒光信號組合特征條形碼，揭示組織中每個細胞內每個位置的RNA身份信息。未來，Xenium還能夠檢測同一組織切片中的RNA和蛋白質表達水平，從而實現組織中復雜而精準的表達模式分析。

通過Xenium原位分析來構建空間轉錄組圖譜。將新鮮冷凍或FFPE組織切片放在Xenium玻片上。對切片進行處理，獲取RNA后用可環化的基因特異性DNA探針進行標記。接著，探針連接后產生可酶促擴增的環狀DNA探針。將玻片置于Xenium分析儀內進行多輪的熒光探針的雜交、成像、解碼和數據處理。

應用范圍和研究領域

Xenium原位分析技術，幫助研究人員能夠確定細胞在其原始組織中的特定位置的基因、蛋白表達模式，獲取詳細的空間信息，該技術將助力多個重要應用領域的研究快速發展，包括：

腫瘤學

揭示腫瘤和免疫微環境中異質性的空間特征，并確定具有潛在治療影響的生物標志物。

免疫學

表征免疫系統和空間定位如何應答傳染病、過敏性炎癥和自身免疫性疾病。

神經科學

揭示復雜神經組織中應對疾病和創傷的空間表達模式。

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